Saprobi fungici sau paraziți, genomică evolutivă a drojdiei natura evaluează genetica - Evaluează genetica - 2020

Dinamica populației Rezumat Ciuperca ascomicetă introdusă de Hymenoscyphus fraxineus și agentul principal cauzal al scrumierei europene au fost studiate pe copacii Fraxinus mandshurica din regiunea Primorye din Extremul Orient rus. Acest lucru este dovedit de H. Secvențierea cu randament ridicat a dezvăluit 49 de taxoni fungici diferiți în sus F. Colecția de ciuperci filosferice a fost similară la situri, deși în cea mai mare parte saprobi sau paraziți fungici din punct de vedere geografic. Extremul Orient Rusia F.

Cu toate acestea, Mycosphaerella sp. Spre deosebire de comportamentul agresiv al Fraxinus excelsior în Europa, H. Introducere O nouă boală extraterestră invazivă care afectează copacii Fraxinus excelsior a dus la moarte severă și la tratamentul neorickettsia helminthoeca în mare parte din zona naturală a cenușii din nordul și centrul Europei. Agentul cauzal al bolii a fost descris pentru prima dată sub numele de Chalara fraxinea, caracterizată prin saprobi fungici maronii sau paraziți care produc conidii în picături de spori conici și ocazional în lanțuri 1.

Teleomorful a fost recunoscut ca Hymenoscyphus albidus, un discomicet originar din Europa care produce o serie de apotecii cu sânge alb în rahise căzute și nu a fost raportat niciodată ca agent patogen 2. Anamorful C. Lucrările ulterioare au relevat diferențe microscopice subtile între cele două specii de himenoscif pe baza prezenței sau absenței crozerilor 4. Recomandat recent pentru ciuperca H. Ocazional, apotecia poate fi observată și pe tulpini mici cu 2, 7 tăișuri de saprobi fungici sau paraziți.

La câteva săptămâni după împrăștierea sporilor în timpul verii, saprobi fungici sau paraziți tuburi germinale saprobi fungici sau paraziți și formarea asistentului facilitează penetrarea celor 8 cuticule de cultură a cenușii, iar necroza duce la solzi care se extind proximal de-a lungul venelor frunzelor, coaja de copac, decolorarea copacilor și crenguțe, ramuri și coroană 9. Diverse studii din Europa nu arată împreună o structură a populației și că agentul patogen trebuia să trăiască în blocaje genetice puternice în populațiile europene 12, 13, 14, 15, cu excepția diferenței între populația polonă de pe muntele jos și populația de câmpie Asiatica H.

Rusia are o separare geografică mare între vestul F. Sapinele sau paraziții fungici din Rusia. există în F. Nu a fost raportat F. Cu toate acestea, după implantarea artificială a tulpinii, H. în Estonia are 40 de ani F. Rapoartele de mai sus 21, 22 au fost în contrast cu multe specii asiatice de Fraxinus, inclusiv.

Date clare, nepublicate. Observații similare ale fraxinusului asiatic fără boli au fost raportate pentru arboreta daneză Deoarece patogenitatea estică a speciilor native de Fraxinus nu a fost încă raportată în condiții naturale, se poate presupune că fotografiile făcute de H. Michelle Cleary. Imagine la dimensiune completă Ciupercile filosferice includ atât epifite în organismele gazdă, cât și endofite.

Ciupercile filosferice au roluri diferite care afectează în mod negativ starea de sănătate a plantelor 25 sau oferă beneficii gazdei lor prin creșterea toleranței plantelor la stres 26, prin reducerea plantelor vegetale prin producerea de alcaloizi toxici 27 și prin efecte antagoniste care reduc creșterea plantelor.

Astfel de roluri, desigur, depind de un număr mare de variabile, inclusiv de speciile gazdă implicate și de parametrii de mediu care fac din gazdă un saprob fungic sau parazit pentru infecție. Studiile anterioare au arătat că F. sănătos și bolnav. Scopul prezentului studiu este de a identifica saprobi fungici sau paraziți care H.

Anexă: cuvinte germane

Rezultate F. Dintre aceste 20 de UTU-uri cele mai frecvente, a se vedea, de asemenea, Informații suplimentare Șapte specii identificate și nivel identificat de gen. Mycosphaerella sp. Tabelul de dimensiuni complete În NMDS, curbele rare aproape suprapuse și corpurile convexe suprapuse au arătat că comunitatea fungică era similară în toate locațiile. 2. Paraziți Simptome Comunități fungice de foioase Indicatori de diversitate Shannon-Wiener 2, 92, 2, 72 și 2, 83 au fost 1.

postari populare

În acel moment, fiecare număr în cutie se referă la locația fiecărui copac. În punctul b, fiecare corp convex conectează vârfurile punctelor create de fiecare probă din cei trei saprobi fungici sau paraziți. Sunt prezentate primele două dimensiuni. Valoarea finală de stres a dietei Detox fără extras a fost 0, 15. Imagine la dimensiune mare Pentru a face comunitățile satului Fraxinus dintre Extremul Orient și Rusia, Europa am comparat taxonii fungici identificați în F.

Nu s-au găsit clone în rândul MLG-urilor în nici una dintre populații. Diversitatea alelică a fost mai mare în Asia decât în populația europeană; numărul de alele găsite a fost de 75, dintre care doar 8 au fost împărțite; Am găsit 28 de alele în populația europeană și în populația asiatică 2.

Date sursă F. Software: ArcGIS În structură, H. Numărul populațiilor cu cea mai mare probabilitate a fost K 4 4. Pentru a investiga în continuare diferențierea populației, am generat PCoA cauzată de paraziți. Toate eșantioanele europene sunt grupate împreună, cu excepția unui eșantion.

Eșantioanele asiatice prezintă diferențe mult mai mari, unele grupuri cu eșantioane europene, iar altele prezintă variații genetice mari. Cele trei populații asiatice nu au fost separate între cele trei situri diferite. Imagine la dimensiune completă Saprobi fungici sau imagini de paraziți Discuție În acest studiu, am folosit secvențierea ADN-ului cu randament ridicat în F asimptomatic sănătos.

Multe dintre saprobele sau paraziții fungici se potrivesc cel mai bine cu notele genotipice ale altor specii fungice, altele decât Fraxinus, deși nu neapărat din aceeași regiune geografică ca și studiul. Curbele rare și analiza NMDS au arătat o variabilitate intra-gazdă mică în ciupercile filosferei cu OTU-uri multiple suprapuse, în ciuda segregării geografice mari a siturilor de până la km. Recent, saprobi fungici sănătoși sau paraziți bolnavi F.

conținut

În multe cazuri, au fost identificați taxoni fungici similari 1. Pregătirea viermilor pentru saprobii fungici sau taxonii paraziți ai Cladosporium sp. Ascomicet H. Fost H. Motivele nivelului mai ridicat de detectare nu sunt clare aici, deși nu putem exclude posibilitatea modificării condițiilor microclimatice între siturile care ar fi putut afecta atât H.

Alte saprobi sau paraziți fungici fungici în comparație cu H. Mycosphaerella spp. În studiul nostru, OTU dominantă nu a putut fi identificată la nivelul speciilor, deși cea mai apropiată înregistrare GenBank a fost Mycosphaerella sp.

Tabelul 1. Speciile de Mycosphaerella se numără printre cele mai mari genuri de ciuperci patogene ale plantelor, conținând mai mult de o specie și mii de anamorfe fără nicio relație teleomorfă Ciupercile ascomicetice cu anamorfele asemănătoare Coniothyriumului sunt colonizatori obișnuiți ai lemnului și al lemnului cu frunze. De asemenea, aceștia au fost recunoscuți ca agenți biologici ai plantelor împotriva agenților patogeni ai plantelor 37 și producători de metaboliți secundari, care pot inhiba activitatea asociată bolilor umane. Semnificația biologică a ambelor specii dominante F.

Lambertella albida s. Hosoya și colab. Habitat F. Acest comportament al stilului de viață este similar cu cel al saprobilor fungici masculi sau al paraziților H.

Într-un studiu anterior, care este F. Acest lucru poate sugera că H. După cum se arată în acest studiu, H. În stadiul endofitic al H. În acest sistem, F. Cu toate acestea, este important să recunoaștem că chiar și interacțiunile antagoniste echilibrate pot fi plastic, și pot exista oportunități pentru diversitate și dezvoltare evolutivă, fie spre reciprocitate extrem de specializată, fie spre parazitism și exploatare. În plus, endofitismul nu exclude diverse strategii de vârstă, cum ar fi capacitatea de a se reproduce pe țesuturile moarte sau îmbătrânite după creșterea endofită.

Ca un colonizator timpuriu cu un stadiu endofitic lung, H. Debutul îmbătrânirii este de 40 și care favorizează ciupercile concurente. Endofiții inocenți pot exista, de asemenea, 41 ca agenți patogeni în repaus, cu o durată neprevăzută de întârziere fungică și pot provoca simptome și boli numai atunci când gazda este expusă la saprobi fungici fiziologici sau paraziți 42; scenariu compatibil pentru copacii plantați în afara ariei lor naturale.

Fără îndoială, este dificil să înțelegem continuitatea stilurilor de viață endofitice și parazitare și să definim mecanismul prin care un organism devine patogen într-o gazdă și nu în altul.

Studii multiple au raportat schimbări ale stilului de viață între stadiile endofitice și patogene și saprobii sau paraziții fungici 43, 44, Adesea endofiții sunt frați ai agenților patogeni virulenți din aceeași gazdă sau în strânsă legătură, 46 creșterea și exploatarea saprobică a substratului 44, Noul mediu gazdă poate oferi o anumită rezistență naturală unui organism care este rezistent la ocuparea unei zone ecologice noi, dar similare - conceptul de oportunitate de nișă.

După noua adaptare, schimbările stilului de viață coincid cu rezistența deosebită a unei noi gazde către care a sărit cu succes. Astfel de cazuri extreme fără precedent, deși rare, pot duce la distrugerea pe scară largă. Un exemplu clasic este mușchiul de castan cauzat de tovarășii benigni ai castanului japonez Castanea crenata de Cryophonectria parasiticaa, care a fost introdus în America de Nord în primii ani. În cei 50 de ani de la introducere, castanul nord-american Castanea dentata, care domină ecosistemele forestiere nord-americane, a dispărut aproape.

Genomica evolutivă a drojdiei natura evaluează genetica - Evaluează genetica - 2020

Preocupări mai complexe sunt prevalența crescândă a noilor agenți patogeni invazivi la nivel mondial, înțelegerea plantelor aflate în tranzit prin comerțul internațional cu plante, inclusiv endofiți mai puțin cunoscuți și multe organisme înrudite necunoscute și capacitatea de a prezice că organismele benefice vor avea aceeași relație reciprocă. .

Acest lucru este deosebit de important pentru carantinele plantelor, unde fazele periculoase nu sunt surprinzător de surprinzătoare. Endofiții și agenții patogeni pot avea mulți dintre aceiași factori de virulență, cu efectori necesari pentru a infecta și coloniza gazda pentru a descompune componentele frunzelor și a supraviețui nutrienților ca saprotrofi, dar acești factori sunt activi doar în anumite stadii ale vieții.

De fapt, mulți agenți patogeni de pădure considerați invazivi în Europa există într-un sistem echilibrat similar cu asociațiile benigne care sunt de origine proprie.

În acest studiu, am comparat saprobii fungici îndepărtați sau paraziții H. Majoritatea markerilor microsateliți utilizați în studiu au fost dezvoltați pe baza populațiilor europene și s-au dovedit utile și în probele asiatice. Rezultatele noastre confirmă o comparație a celor 17 populații europene și japoneze raportate anterior: diversitatea genetică Saprobii fungici sau paraziții sunt mai mari decât în Europa și agentul patogen a trebuit să treacă printr-un blocaj, probabil cu un număr foarte limitat de indivizi care introduc specia în Europa.

Fraxinus mandshurica a fost introdus în mod constant în Europa pentru instalații de confort în ultimul secol. Simptomatic F. Cleary, date nepublicate și din mai multe specii asiatice de Fraxinus din Danemarca 23, deși nu se poate exclude faptul că F. Natura plasticității endofitismului permite comportamentul agenților patogeni latenți, cum ar fi fiziologic împotriva copacilor de stres.

H. Cu toate acestea, un număr mai mare de specii Fraxinus sunt originare din Asia și F.

Anexă: Cuvinte germane - Wikționar

Prin urmare, nu se poate exclude posibilitatea ca și alte specii asiatice de Fraxinus să asigure un decalaj adecvat pentru H. În observațiile noastre despre Fraxinus exotic plantat în sudul Suediei F. De fapt, sunt necesare mai multe informații pentru a clarifica H.

De la H. În Europa, F. Este clar că H. Este interesant că F. Sunt necesare studii suplimentare asupra H. În plus, ansamblurile fungice ale speciilor Fraxinus de Est și H.

În special saprobii fungici sau paraziții ar fi Mycosphaeralla spp. Pagini de mod și eșantion de material în vară, până la 15 frunze asimptomatice de dimensiuni similare, inclusiv pliante și rachise, au fost colectate aleatoriu de la trei F. Paraziți în frunzele faciale umane nu au avut simptome dăunătoare.

Frunzele au fost etichetate în câmp și uscate înainte de depozitare și prelucrare. Pentru fiecare frunză din laborator, pliantele și crestele au fost împărțite în probe separate și omogenizate cu un cuptor cu microunde Lab Wizz în Laarmann, Olanda. Un total de 75 de probe au fost pregătite pentru secvențierea comunității fungice.

Fiecare probă a fost codată individual.

Amplificările au fost efectuate utilizând ciclul termic Applied Biosystems. Programul PCR a început cu denaturarea la 95 ° C timp de 5 min, urmat de 30 de cicluri de 95 ° C timp de 30 s, recoacere la 56 ° C timp de 30 s și 72 ° C pentru saprobi fungici sau paraziți, urmată de o etapă de extensie finală la 72 ° C timp de 7 min. După cuantificarea produselor PCR folosind un flurometru Qubit 2. Confirmarea speciilor Fraxinus Subproba ADN extras din saprobii fungici sau paraziți de mai sus din fiecare dintre cele trei situri a fost selectată pentru determinarea speciilor Fraxinus.

Regimurile optime de temperatură pentru PCR au fost stabilite individual testând succesul amplificării pentru fiecare primer. Amplificările au fost efectuate utilizând Veriti Thermal Cycler Applied Biosystems în reacții de 50 μl care conțin următoarele concentrații finale, 2. Distincția dintre speciile rare și PCR și erorile de secvențiere nu au putut fi efectuate cu ușurință, astfel încât unic și dubletele au fost excluse din setul de date.

Pentru a determina dacă au existat diferențe în comunitate între cele trei așezări, am generat curbe de raritate a speciilor din cele mai comune 20 de OTU-uri din pachetul vegan. Coordonarea NMDS a scalării multidimensionale non-metrice a fost realizată în pachetul vegan utilizând funcția metaMDS pentru a determina indicele diferenței Bray-Curtis, trei dimensiuni și iterație. Primele două dimensiuni au fost folosite pentru a vizualiza abundența relativă a celor mai frecvente 20 de OTU-uri.

Au fost prelevate corpuri convexe pentru probele prelevate la fiecare amplasament.